单细胞测序技术（single cell sequencing）是指在单个细胞水平上，对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项新技术，它能够弥补传统高通量测序的局限性，揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态，反映细胞间的异质性。单细胞转录组测序技术广泛地应用于肿瘤、发育生物学、微生物学、神经科学、以及植物学等领域，具有广阔的应用前景。